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粮油所完成高蛋白大豆种质冀HJ117基因组组装
作者:刘智   审核:闫龙   编辑:段鹏伟   上传:贾沛雯   发布时间:2024/3/11 16:43:59   信息来源:粮油作物研究所


高蛋白大豆育种是粮油所大豆中心优势研究方向。冀HJ117是大豆中心以高蛋白品种冀豆12为亲本,通过有限回交和低世代定向选择而育成,蛋白质含量52.99%,远超45.0%的高蛋白品种国审标准。按照院党组“以本单位优良品种或材料为研究对象,在基础研究、应用基础研究上有所突破”的工作要求,粮油所完成了冀HJ117基因组组装工作,研究结果在学术期刊《BMC genomic data》发表。
        本研究结合基因组二代测序、基因组三代测序、染色质捕获等技术,将基因组组装到染色体水平。组装基因组长度为1041.94 Mb,contig N50长度和scaffold N50的长度分别为19.32 Mb和51.43 Mb,共注释出54,550个基因,CEGMA和BUSCO检测结果分别为97.18%和99.4%,相关指标达到同期一流水平。研究结果为通过分子设计育种培育突破性高蛋白大豆新品种奠定了基础。
        粮油所刘智博士、杨庆博士和刘兵强副研究员为共同第一作者,张孟臣研究员和闫龙研究员为共同通讯作者。本研究得到了国家重点研发计划等课题资助。
        论文发表地址:
        https://doi.org/10.1186/s12863-024-01213-1



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关键词:粮油所,大豆,高蛋白,基因组,从头组装阅读:424
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